微生物学分类与命名

微生物学分类体系基于一系列等级，包括界、门、纲、目、科、属和种。种是最基础的分类单位，它下面可能还有亚门、亚纲、亚目和亚科等。以啤酒酵母为例，其分类地位是这样的：它属于真菌界的界，接着是真菌门，子囊菌纲，内孢霉目，内孢霉科，酵母属，最终是啤酒酵母种。

种的定义是高度相似且遗传关系亲近的菌株集合，区分于同一属内其他种。菌株，即由单一细胞繁殖形成的纯种群体，其后代保持共同祖先的特性。比如大肠埃希氏杆菌，EscherichiacoliB和EscherichiacoliK12就是不同来源的菌株，它们属于同一个种但存在差异。

在种的分类中，亚种和变种用于区分种内的变异特征或遗传性状。如果差异不足够显著以形成新种，就可能细分为亚种，如E.colik12的某aa缺陷型。型则更细，通常指亚种以下的分类，依据微生物的特性如抗原特征进行划分。

微生物的命名包含俗名和学名。学名，由国际微生物分类委员会制定，遵循拉丁文或拉丁化外来词。双名法是常见形式，如大肠埃希氏杆菌的学名Escherichiacoli（Migula）CastellanietChalmers1919。对于未特定种名的属，会用sp.或ssp.。例如，Saccharomycessp.表示酵母菌属的某一种，菌株名称则会加上编号或地名，如BacillussubtilisBF7658。

三名法用于亚种命名，如Bacillusthuringiensissubsp.galleria，它代表苏云金芽孢杆菌的腊螟亚种。在文章中，如果已提及某个学名，通常会使用简写，如Escherichiacoli缩写为E.coli或Staphylococcusaureus缩写为S.aureus。

微生物学（microbiology）生物学的分支学科之一。它是在分子、细胞或群体水平上研究各类微小生物（细菌、放线菌、真菌、病毒、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体原生动物以及单细胞藻类）的形态结构、生长繁殖、生理代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生命活动的基本规律，并将其应用于工业发酵、医学卫生和生物工程等领域的科学。