什么是分子标记？

什么是分子标记？分子标记的种类~

分子标记的概念有广义和狭义之分。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。
分子标记（Molecular Markers），是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比，DNA分子标记具有的优越性有：大多数分子标记为共显性，对隐性的性状的选择十分便利；基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；在生物发育的不同阶段，不同组织的DNA都可用于标记分析；分子标记揭示来自DNA的变异；表现为中性，不影响目标性状的表达，与不良性状无连锁；检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展，DNA分子标记技术已有数十种，广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。

分子标记是生物遗传标记的一种。通过引物设计的不同，用PCR的方法在生物的基因组DNA上扩增出相关条带，通过电泳、软件识别、分析，可用作生物遗传信息的研究。
分子标记种类有很多，第一代分子标记以RFLP为代表，是基于酶切位点的多态性开发的分子标记。
第二代分子标记以SSR为代表，是基于简单重复序列的多态性。第二代分子标记通过引物的特殊设计，能够扩增DNA上的相应位置的序列，根据它们的多态性，进行下一步分析。
第三代分子标记以SNP为代表，单核苷酸多态性。是基于高通量测序为基础的新一代分子标记技术。

长期以来，植物育种中选择都是基于植株的表型性状进行的，当性状的遗传基础较为简单或即使较为复杂但表现加性基因遗传效应时，表型选择是有效的。但许多重要农艺性状为数量性状，如产量等；或多基因控制的质量性状，如抗性等；或表型难以准确鉴定的性状，如根系活力等，此时根据表型提供的对性状遗传潜力的度量是不确切的，因而选择是低效的。

遗传育种家们很早就提出了利用标记进行辅助选择以加速育种改良进程的设想。形态学标记等常规遗传标记是最早用于植物育种辅助选择的标记，但由于它们数量少、遗传稳定性差，且常常与不良性状连锁，因而利用受到很大限制。近十年来，分子生物学技术的发展为植物育种提供了一种基于DNA变异的新型遗传标记——DNA分子标记，或简称分子标记。

与传统应用的常规遗传标记相比，分子标记具有许多明显的优点，因而已被广泛应用于现代作物遗传育种研究的各个方面，正在为植物育种技术带来一场新的变革。

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